Je conseillerais d'analyser le résultat de SHOW CREATE TABLE temporary_table;
Pour extraire uniquement le ENGINE de cette valeur de retour :
$rset = mysql_query('SHOW CREATE TABLE temporary_table;')
$row = mysql_fetch_array($rset, MYSQL_BOTH);
preg_match('/ENGINE\=(?P<engine>\w+)/', $row[1], $matches);
echo $matches['engine'];