J'ai eu le même problème il y a quelques semaines. Le dossier de base de données sur le système de fichiers appartenait au mauvais utilisateur. Un simple chown -R mysql:mysql /var/lib/mysql/database_name
a fait l'affaire !
Tout est expliqué ici :http://www.dinosources.eu/2010 /10/mysql-cant-create-table (c'est italien, mais c'est assez clair)
Bravo