SELECT id HAVING nombre maximum d'id

SELECT color_id AS id, COUNT(color_id) AS count 
FROM products 
WHERE item_id = 1234 AND color_id IS NOT NULL 
GROUP BY color_id 
ORDER BY count DESC
LIMIT 1;

Cela vous donnera le color_id et le nombre de ce color_id classés par le nombre du plus grand au moins. Je pense que c'est ce que vous voulez.

pour votre modification...

SELECT color_id, COUNT(*) FROM products WHERE color_id = 3;