Lorsque vous ftp le fichier le copie-t-il réellement là où vous l'attendez, avec le nom correct ? Vous voudrez peut-être mettre le chemin absolu vers le fichier.
J'ai tendance à faire fonctionner le package SSIS à partir de la ligne de commande avant d'essayer de l'exécuter à partir d'une application, ce qui est plus facile à déboguer de cette façon.