L'article "Apporter des modifications de schéma sur les bases de données de publication" devrait couvrir la plupart de ce que vous devez savoir. Contrairement aux anciennes versions de SQL Server, vous devriez simplement pouvoir apporter les modifications DDL (en supposant que vous n'avez pas annulé les valeurs par défaut de réplication).
Comme le mentionne l'article, vous ne pourrez pas utiliser SSMS pour effectuer ces modifications.
