Convertir simplement en chaîne :
db.session.query(Vehicle).filter(str(Car.id) == Vehicle.value)
si Car.id
est une variable locale qui est un int.
Si vous avez besoin de l'utiliser dans une jointure, demandez à la base de données de le convertir en chaîne :
from sqlalchemy.sql.expression import cast
db.session.query(Vehicle).filter(cast(Car.id, sqlalchemy.String) == Vehicle.value)
Si la valeur de chaîne dans l'autre colonne contient des chiffres et éventuellement des espaces vous devrez peut-être envisager de couper ou de convertir la valeur de la chaîne en un entier (et de laisser la colonne d'entiers un entier).