Dans ce cas particulier, il est préférable de descendre au niveau DB-API, car vous avez besoin de certains outils qui ne sont même pas exposés directement par SQLAlchemy Core, tels que copy_expert()
. Cela peut être fait en utilisant raw_connection()
. Si vos données source sont un fichier CSV, vous n'avez pas du tout besoin de pandas dans ce cas. Commencez par créer une table intermédiaire temporaire, copiez les données dans la table temporaire et insérez-les dans la table de destination avec gestion des conflits :
conn = engine.raw_connection()
try:
with conn.cursor() as cur:
cur.execute("""CREATE TEMPORARY TABLE TEST_STAGING ( LIKE TEST_TABLE )
ON COMMIT DROP""")
with open("your_source.csv") as data:
cur.copy_expert("""COPY TEST_STAGING ( itemid, title, street, pincode )
FROM STDIN WITH CSV""", data)
cur.execute("""INSERT INTO TEST_TABLE ( itemid, title, street, pincode )
SELECT itemid, title, street, pincode
FROM TEST_STAGING
ON CONFLICT ( itemid )
DO UPDATE SET title = EXCLUDED.title
, street = EXCLUDED.street
, pincode = EXCLUDED.pincode""")
except:
conn.rollback()
raise
else:
conn.commit()
finally:
conn.close()
Si au contraire votre source de données est le DataFrame
, vous pouvez toujours utiliser COPY
en en passant une fonction comme méthode method=
à to_sql()
. La fonction pourrait même masquer toute la logique ci-dessus :
import csv
from io import StringIO
from psycopg2 import sql
def psql_upsert_copy(table, conn, keys, data_iter):
dbapi_conn = conn.connection
buf = StringIO()
writer = csv.writer(buf)
writer.writerows(data_iter)
buf.seek(0)
if table.schema:
table_name = sql.SQL("{}.{}").format(
sql.Identifier(table.schema), sql.Identifier(table.name))
else:
table_name = sql.Identifier(table.name)
tmp_table_name = sql.Identifier(table.name + "_staging")
columns = sql.SQL(", ").join(map(sql.Identifier, keys))
with dbapi_conn.cursor() as cur:
# Create the staging table
stmt = "CREATE TEMPORARY TABLE {} ( LIKE {} ) ON COMMIT DROP"
stmt = sql.SQL(stmt).format(tmp_table_name, table_name)
cur.execute(stmt)
# Populate the staging table
stmt = "COPY {} ( {} ) FROM STDIN WITH CSV"
stmt = sql.SQL(stmt).format(tmp_table_name, columns)
cur.copy_expert(stmt, buf)
# Upsert from the staging table to the destination. First find
# out what the primary key columns are.
stmt = """
SELECT kcu.column_name
FROM information_schema.table_constraints tco
JOIN information_schema.key_column_usage kcu
ON kcu.constraint_name = tco.constraint_name
AND kcu.constraint_schema = tco.constraint_schema
WHERE tco.constraint_type = 'PRIMARY KEY'
AND tco.table_name = %s
"""
args = (table.name,)
if table.schema:
stmt += "AND tco.table_schema = %s"
args += (table.schema,)
cur.execute(stmt, args)
pk_columns = {row[0] for row in cur.fetchall()}
# Separate "data" columns from (primary) key columns
data_columns = [k for k in keys if k not in pk_columns]
# Build conflict_target
pk_columns = sql.SQL(", ").join(map(sql.Identifier, pk_columns))
set_ = sql.SQL(", ").join([
sql.SQL("{} = EXCLUDED.{}").format(k, k)
for k in map(sql.Identifier, data_columns)])
stmt = """
INSERT INTO {} ( {} )
SELECT {}
FROM {}
ON CONFLICT ( {} )
DO UPDATE SET {}
"""
stmt = sql.SQL(stmt).format(
table_name, columns, columns, tmp_table_name, pk_columns, set_)
cur.execute(stmt)
Vous insérez alors le nouveau DataFrame
en utilisant
df.to_sql("test_table", engine,
method=psql_upsert_copy,
index=False,
if_exists="append")
En utilisant cette méthode, la mise à jour d'environ 1 000 000 lignes a pris environ 16 secondes sur cette machine avec une base de données locale.