Vous pouvez utiliser ceci :http://www.ozerov.de/bigdump/
Ou
Utilisez cette commande pour diviser le fichier sql
split -l 5000 ./path/to/mysqldump.sql ./mysqldump/dbpart-
La commande split prend un fichier et le divise en plusieurs fichiers. La partie -l 5000 lui dit de diviser le fichier toutes les cinq mille lignes. Le bit suivant est le chemin d'accès à votre fichier et la partie suivante est le chemin dans lequel vous souhaitez enregistrer la sortie. Les fichiers seront enregistrés sous le nom de fichier que vous spécifiez (par exemple "dbpart-") avec une combinaison de lettres alphabétiques en annexe.
Vous devriez maintenant pouvoir importer vos fichiers un par un via phpMyAdmin sans problème.
Plus d'informations http://www.webmaster-source.com/2011/09/26/how-to-import-a-very-large-sql-dump-with-phpmyadmin/