La version de MySQL est différente dans phpmyadmin

Essayez de supprimer php-mysql et d'installer php-mysqlnd. Se fera automatiquement en suivant les commandes

sudo add-apt-repository ppa:nijel/phpmyadmin
sudo apt-get update
sudo apt-get install php5-mysqlnd

sudo apt-get --purge --reinstall install phpmyadmin

Ou vous pouvez essayer de réinstaller votre phpmyadmin