Je viens de trouver la réponse sur ce fil :PHPMyAdmin - Le nombre total d'enregistrements varie
Il semble que l'ajout d'un paramètre de configuration dans config.inc.php fasse l'affaire :http://www.kavoir.com/2012/07/make-phpmyadmin-show-exact-number-of-records-for-innodb-tables.html
Ajoutez simplement cette ligne dans config.inc.php :
$cfg['MaxExactCount'] = 2000000;
Ainsi, toute table InnoDB avec moins de 2000000 lignes aura un nombre exact de lignes affichées.
Faites en sorte que ce nombre soit suffisamment grand et toutes les tables InnoDB de votre base de données auront un nombre exact de lignes sur la page de base de données phpMyAdmin.