Je l'ai finalement trouvé.
Apparemment, il y avait des problèmes d'incompatibilité après la mise à niveau vers MySQL 5.6.
Afin de vérifier ces problèmes et de les résoudre, vous devrez effectuer une mise à niveau MySQL.
Exécutez simplement ce qui suit sur un terminal :
mysql_upgrade -u root -p
Saisissez votre mot de passe et attendez la fin de la mise à niveau.
Cela a résolu le problème pour moi.