Les requêtes mongoexport nécessitent l'utilisation du JSON étendu MongoDB en mode strict. Vous pouvez en savoir plus sur cette variante de JSON étendu dans l'article du manuel MongoDB sur JSON étendu . Dans votre cas spécifique, la bonne façon d'écrire la première requête dans la commande mongoexport est
mongoexport.exe -h *MYHOST* -p *MYPORT* -q "{ 'time' : { '$gte' : { '$date' : '2014-12-21 12:57:00.506Z' },'$lt' : { '$date' : '2014-12-21 12:59:00.506Z' } } }"