Vous devez donner les champs récupérés comme deuxième paramètre de la méthode findOne
BasicDBObject retrievedField = new BasicDBObject();
retrievedField.put("_id",0);
dbcoll.findOne(query, retrievedField);
Aussi, si vous voulez récupérer la requête exacte que vous avez montrée, je pense que vous devez ajouter l'objet elemMatch à retrievedFields au lieu de l'ajouter à queryObject.
BasicDBObject eleMatch = new BasicDBObject();
eleMatch.put("cityName","A");
BasicDBObject up = new BasicDBObject();
up.put("$elemMatch",eleMatch);
retrievedField.append(up);
BasicDBObject query = new BasicDBObject();
query.put("name","abc");
DBCollection dbcoll = mongoTemplate.getCollection("sample");
DBObject object = dbcoll.findOne(query, retrievedField);