Vous n'avez pas précisé si vous cherchiez à définir des méthodes de classe ou d'instance. Comme d'autres ont couvert les méthodes d'instance, voici comment définir une méthode de classe/statique :
animalSchema.statics.findByName = function (name, cb) {
return this.find({
name: new RegExp(name, 'i')
}, cb);
}