Mysql
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Supprimer les fichiers qui ne sont pas dans une TABLE mySQL

Sélectionnez simplement toutes les images qui ne doivent pas être supprimées de la base de données et parcourez tous les fichiers.

$result = mysql_query("SELECT filename FROM no_delete");
while($row = mysql_fetch_assoc($result)) {
   $do_not_delete[] = $row['filename'];
}

foreach(glob("*") as $filename) {
    if (!in_array($filename, $do_not_delete)) {
        //delete them
    }
}