Je pense que vous voulez juste une agrégation conditionnelle, pas des sous-requêtes :
select Max(Counting) as Total, student, stdType,
sum(case when score = '3' then 1 else 0 end) as Score3,
sum(case when score = '4' then 1 else 0 end) as Score4
from #tempBWMSHonors3
group by student, stdType;
Remarque :si le score est un nombre et non une chaîne, vous ne devez pas utiliser de guillemets simples pour la constante.