Je ne pense pas que l'hébergement Windows permette de personnaliser PHP5.ini :(
Je vérifie leur site d'aide et cet article auquel vous avez lié concernait les serveurs Linux.
En outre, comparez les forfaits sur cette page :http://www.godaddy .com/gdshop/hosting/shared.asp?ci=9009 montre que Linux autorise PHP5.ini personnalisé mais pas Windows
Je me demande si essayer d'en utiliser un ne bousille pas le PHP et rend la fonction "mysql_connect" que vous essayez d'utiliser indisponible.