Obtenez des données MySql et stockez-les dans un tableau Javascript

while($row= mysqli_fetch_assoc($dbcon,$result)){
    $data[] = array("lat"=>$row["geo_lat"], "lon"=>$row["geo_long"], "value"=>1);
}
echo json_encode($data);

devrait vous procurer ce que vous cherchez. lors de la création de données pour json_encode, utilisez simplement des types php natifs au lieu de json, laissez json_encode s'en occuper