Jointure entre tables dans deux bases de données différentes ?

Oui, en supposant que le compte dispose des autorisations appropriées que vous pouvez utiliser :

SELECT <...>
FROM A.table1 t1 JOIN B.table2 t2 ON t2.column2 = t1.column1;

Il vous suffit de préfixer la référence de la table avec le nom de la base de données dans laquelle elle réside.