Mieux vaut plus tard que jamais )
Si vous utilisez d'abord le code et les classes de mappage manuel, utilisez la configuration HasColumnType("INT") pour les propriétés int.
Par exemple :
var entity = builder.Entity<APP_TABLE>();
entity
.HasKey(x => x.ID)
.ToTable("APP_TABLE", "SCHEMA");
entity
.Property(x => x.ID)
.HasColumnType("INT");