Définissez la valeur par défaut de la colonne à l'aide de alter table Instruction SQL :
alter table myTable alter column myIdColumn default newid()
Du côté C#, décorez votre classe EF pour indiquer que la valeur de cette colonne est générée automatiquement :
[DatabaseGenerated(DatabaseGeneratedOption.Identity)]
Guid myIdColumn { get; set; }
