Utilisez un cte
et attribuez des numéros de ligne afin que toutes les paires en double sauf une puissent être supprimées.
with rownums as
(select m.*,
row_number() over(partition by ToUserId, FromUserId order by ToUserId, FromUserId) as rnum
from Message m)
delete r
from rownums r
where rnum > 1