Vous pouvez le faire avec une simple mise à jour :
UPDATE your_table SET password_col = ENCRYPT(password_col,'some salt')
Ou, si vous utilisez LOAD DATA INFILE pour remplir le tableau, vous pouvez chiffrer les mots de passe puis :
LOAD DATA INFILE '/tmp/data.csv' INTO TABLE your_table
(col1,...,@password,...,coln)
set password_col = ENCRYPT(@password,'some salt')