Ceci n'est pas pris en charge dans la version actuelle (v2.0) de mongoimport, mais cela devrait arriver bientôt. Vous pouvez consulter le ticket JIRA ici, prévu pour la v2.1 :
Jusque-là, si vous pouvez traduire vos données CSV en JSON, vous pouvez utiliser mongoimport --type json
pour importer les données imbriquées.
MODIF : Cette fonctionnalité est désormais disponible et disponible à partir de 2.8.0-rc0