Malheureusement, la mise à jour de tous les documents dans le tableau n'est pas possible maintenant - voir le ticket MongoDB JIRA éléments d'un tableau .
Vous pouvez mettre à jour chaque document manuellement :
db.MyDB.find({}).forEach(function(doc) {
doc.myArray.forEach(function(item) {
if (item.b === true)
item.b = false;
});
db.MyDB.update({ "_id": doc._id }, { "$set": { "myArray": doc.myArray }});
});