En fin de compte, j'ai oublié d'ajouter sqlparse à mon requirements.txt et, par conséquent, heroku n'a pas pu exécuter l'analyse SQL de Djongo dans noSQL. Basé sur ce problème il semble que la version 0.2.4 soit la version la plus stable à utiliser.
requirements.txt
django==2.2.12
djongo==1.3.2
gunicorn==19.9.0
django-heroku==0.3.1
django-crispy-forms==1.9.0
dnspython==1.16.0
sqlparse==0.2.4