Essayez $unset dans un appel à update() .
Comme ceci :
db.collection_name.update({ _id: 1234 }, { $unset : { description : 1} })
Et, comme l'a commenté vikneshwar, si vous souhaitez supprimer un champ de tous (ou de plusieurs) documents, vous pouvez utiliser updateMany() comme ceci :
db.collection_name.updateMany({}, { $unset : { description : 1} })