Je l'ai réparé moi-même.
J'ai fait ceci dans mon modèle :
loc : { type: {type:String}, coordinates: [Number]},
En dessous, j'en ai fait un index 2dsphere.
eventSchema.index({loc: '2dsphere'});
Et pour y ajouter des données :
loc: { type: "Point", coordinates: [ longitude, latitude ] },